MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN7

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009653	GAC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009653	T	7	7	102	108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009653	AGTCA	2	10	126	135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009653	GTC	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009653	TGCA	2	8	372	379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009653	GGT	2	6	431	436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009653	TTG	2	6	437	442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009653	GT	3	6	559	564	0 %	50 %	50 %	0 %	152973837
9	NC_009653	AC	3	6	583	588	50 %	0 %	0 %	50 %	152973837
10	NC_009653	CTG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973837
11	NC_009653	TCA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973837
12	NC_009653	AACT	2	8	651	658	50 %	25 %	0 %	25 %	152973837
13	NC_009653	CTGCGG	2	12	686	697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973837
14	NC_009653	ACC	2	6	747	752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973837
15	NC_009653	CTG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973837
16	NC_009653	TTCT	2	8	810	817	0 %	75 %	0 %	25 %	152973837
17	NC_009653	TTC	2	6	822	827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973837
18	NC_009653	TGT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973837
19	NC_009653	GTTG	2	8	995	1002	0 %	50 %	50 %	0 %	152973837
20	NC_009653	TGAA	2	8	1054	1061	50 %	25 %	25 %	0 %	152973837
21	NC_009653	ATGA	2	8	1071	1078	50 %	25 %	25 %	0 %	152973837
22	NC_009653	TGCT	2	8	1184	1191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009653	T	9	9	1220	1228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009653	A	8	8	1262	1269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009653	T	9	9	1270	1278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009653	ACT	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009653	TATT	2	8	1307	1314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009653	AGT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009653	TACAA	2	10	1381	1390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009653	TAT	2	6	1429	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973838
31	NC_009653	GCT	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973838
32	NC_009653	AGC	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973838
33	NC_009653	TGT	2	6	1522	1527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973838
34	NC_009653	GAA	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973838
35	NC_009653	GAC	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973838
36	NC_009653	CCAG	2	8	1675	1682	25 %	0 %	25 %	50 %	152973839
37	NC_009653	GCAG	2	8	1728	1735	25 %	0 %	50 %	25 %	152973839
38	NC_009653	TGA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973839
39	NC_009653	TGT	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973839
40	NC_009653	ACT	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973839
41	NC_009653	ACA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973839
42	NC_009653	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973839
43	NC_009653	ATT	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973839
44	NC_009653	A	7	7	1997	2003	100 %	0 %	0 %	0 %	152973839
45	NC_009653	TTTC	2	8	2136	2143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009653	AGT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009653	G	6	6	2248	2253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009653	CCA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009653	G	6	6	2478	2483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009653	TC	3	6	2520	2525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009653	CTGT	2	8	2532	2539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009653	TG	3	6	2552	2557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009653	CGC	2	6	2571	2576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009653	TGAG	2	8	2602	2609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009653	CTT	2	6	2661	2666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009653	ACA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973840
57	NC_009653	CTG	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973840
58	NC_009653	CTTGAT	2	12	2751	2762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152973840
59	NC_009653	ATG	3	9	2791	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973840
60	NC_009653	AAC	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973841
61	NC_009653	TTAA	2	8	2924	2931	50 %	50 %	0 %	0 %	152973841
62	NC_009653	CTT	2	6	3188	3193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973841
63	NC_009653	TGG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973841
64	NC_009653	CAC	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009653	CA	3	6	3361	3366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009653	AAAATT	2	12	3373	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009653	TTA	2	6	3420	3425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009653	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.